本研究证实IolR通过下调嗜水气单胞菌RpmA的表达来抑制细胞的自聚集和生物膜形成,从而进一步减少与钙的接触机会,进而抑制凝集形成和生物膜的形成所需的细胞-细胞相互作用。这项研究对IolR在嗜水气单胞菌中的作用提供了理论基础,并为寻找治疗这种细菌感染的药物靶点提供了新的线索。
原核转录组测序可以从基因表达量、基因结构和sRNA调控功能三维度揭示不同生物性状的分子调控机制。如通过计算各组间的差异基因并对差异基因进行富集分析,获得对生物性状影响较大的通路信息;通过预测基因的反义转录本,丰富基因组注释内容;研究sRNA对mRNA的相互作用,从分子调控角度解释生物性状196体育官方网站之间的差异。
针对检测原核菌个性化设计rRNA去除探针,利用高通量技术对原核细胞所产生的所有mRNA和sRNA(非编码RNA)进行测序。系统全面解析特定细胞所产生的mRNA和sRNA对生物性状的影响。
嗜水气单胞菌是鱼类运动性气单胞菌败血症的病原体。嗜水气单胞菌的发病机制是复杂的196体育平台首页、多因素的,涉及粘附素、毒素和铁元素摄取系统等多种毒力因子。尽管不断有新的毒力因子被人们发现,但这种细菌的致病机制仍不清楚196体育平台首页。
IolR是一种转录抑制因子,可以负向调节肌醇代谢活性。作者在养殖死亡的鲤鱼中分离出来嗜水气单胞菌NJ-35细菌,采用同源重组的方法构建了一株IolR基因缺失菌株,将ΔiolR突变体菌株与野生型菌株进行比较分析。对细菌在LB培养基上的生长情况进行评估,并进行转录组比较分析和qRT-PCR验证,以鉴定<196体育官方网站a href=http://yljinshu.com target=_blank>196体育官方网站IolR在嗜水气单胞菌NJ-35中的功能。
本研究证实IolR通过下调嗜水气单胞菌RpmA的表达来抑制细胞的自聚集和生物膜形成,从而进一步减少与钙的接触机会196体育平台首页,进而抑制凝集形成和生物膜的形成所需的细胞-细胞相互作用。这项研究对IolR在嗜水气单胞菌中的作用提供了理论基础,并为寻找治疗这种细菌感染的药物靶点提供了新的线索。
原核转录组分析表明差异表达基因大多涉及膜部分、转运、细胞代谢和信号转导等功能